侵染假酸浆的泰国番茄黄化曲叶病毒全基因组结构特征.pdf

nullnullnullnullnull nullnull null nullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull 收稿日期 nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull 修订日期 nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull 基金项目 null 国家自然科学基金 nullnullnullnull 云南省基础研究计划 nullnullnullnullnullnullnullnullnull 云南省农业基础研究联合专项 nullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnull nullnullnullnull年 云南省农业科学院科技创新及成果转化试点专项 nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnull null 通信作者 null nullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull null 为并列第一作者 侵染假酸浆的泰国番茄黄化曲叶病毒 全基因组结构特征 张水英 null null 赵丽玲 null null 钟 null 静 null 李婷婷 null 丁 null 铭 null 云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所 云南省农业生物技术重点实验室 农业农村部西南作物 基因资源与种质创制重点实验室 昆明 nullnullnullnullnullnullnull 摘要 null 为明确假酸浆 nullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull 叶片黄化 皱缩症状是否由菜豆金色花叶病毒属病毒侵染引起 本研究 利用分子检测方法和生物信息学技术鉴定了假酸浆样品中的病毒种类 从采集的病样中克隆并获得了 null条菜豆金 色花叶病毒属病毒 nullnullnull nullnull 全序列和 null条 nullnullnullnull卫星全序列 经全序列分析发现 该双生病毒的两条 nullnullnull nullnull 全序列 与泰国番茄黄化曲叶病毒 nullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnull 云南分离物 nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull一 致性最高 达 nullnullnullnullnull 亲 缘 关 系 较 近 nullnullnullnull卫星的全序列与云南番茄曲叶 nullnullnullnull卫 星 nullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnull 的分离物 nullnullnullnullnullnull一致性最高 达 nullnullnullnullnull 亲缘关系较近 重组分析显示 假酸浆上分离的 nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull是一个重组病毒 有两个重组事件 一个主要发生在 nullnullnull的编码区 由中国番茄黄化曲叶 病毒 nullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnull 和广西大戟曲叶病毒 nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnull nullnullnullnullnull 重组形成 另一个重组事件主要发生在基因间隔区 nullnull区 由泰国烟草卷叶病毒 nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnull 和 nullnullnullnullnullnullnull重组形成 研究结果表明 假酸浆是 nullnullnullnullnullnullnull的新寄主 这是单组分菜豆 金色花叶病毒属病毒及其伴随 nullnullnullnull卫星侵染假酸浆的首次报道 关键词 null 假酸浆 null 泰国番茄黄化曲叶病毒 null 基因组特征 null 重组 中图分类号 nullnullnullnullnullnullnullnullnullnull 文献标识码 nullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnull null null null nullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnull null nullnull null null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull null nullnull null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnull null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnull null nullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull null nullnull null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnull null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnull null nullnull null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnull null nullnull null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnull nullnull null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnull nullnullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnullnullnull null nullnullnull nullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnull nullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnull null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnull 烟粉虱 nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull 传播的菜豆金色花叶病 毒属 nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull 病毒是双生病毒科 nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnull 中种类最多 分布最广 造成危害最严重的一类 病毒 null 按基因组结构分为双组分病毒和单组分病 毒 双组分病毒由两条大小 nullnullnullnullnullnullnullnullnull 的 nullnullnullnull null 和 nullnullnullnullnull 组成 单组分病毒只含有 null 条大小约为 nullnullnullnullnull 的基因组 nullnullnullnullnull 其全基因组含有 null 个 开放阅读框 正义链上的 nullnullnull 和 nullnullnull 基因分别编 码 nullnull 蛋白和 nullnullnullnullnullnull 蛋白 反义链上的 nullnullnull nullnullnull nullnullnull 和 nullnullnull 基因分别编码 nullnullnull nullnullnullnull nullnullnull 和参与 病毒系统运动的蛋白 null 单组分病毒通常与 nullnullnullnull 卫星或与 nullnullnullnull 卫星和 nullnullnullnullnull 卫星相伴随复合侵染 植物 nullnullnull nullnullnullnull 卫星的基因组 nullnullnullnullnullnullnull 大小约为 nullnullnullnullnullnull 是其辅助的病毒基因组大小的一半左右 nullnullnullnullnullnullnull 保守 区 含 有 保 守 的 null 碱 基 序 列 nullnullnullnullnullnullnullnull nullnull nullnullnull nullnullnullnullnullnullnull 的一个开放阅读框编码 null nullnull 蛋 白 null nullnull 蛋白能够引起典型的病毒侵染症状 并能 提高所辅助病毒在寄主植物中的积累量 null nullnullnullnull 年 nullnull 等 null 研究发现 很多 nullnullnullnull 卫星的病毒链还可 编码 null nullnull 蛋白 null nullnull 蛋白有助于病毒的侵染 泰国番 茄 黄 化 曲 叶 病 毒 nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnull 于 nullnullnullnull 年首次发 现于泰国田间的番茄上 null 其基因组由两条大小均 约为 nullnullnullnullnull 的 nullnullnullnullnull 和 nullnullnullnullnull 组成 是一种双 组分菜豆金色花叶病毒属病毒 nullnullnullnullnull nullnullnullnull 年 nullnull 等 在云南从表现为卷叶的番茄上发现的 nullnullnullnullnullnullnull 是单组分病毒 有 null 个样品还检测到 nullnullnullnullnullnullnull 序 列 nullnull nullnullnullnull 年 nullnullnull 等首次在台湾番茄上发现的 nullnullnullnullnullnullnull 是 双 组 分 病 毒 但 并 未 发 现 有 卫 星 nullnullnull nullnull nullnullnullnull 年 nullnullnull 等在云南保山番茄上分离到 的 nullnullnullnullnullnullnull 是一种单组分病毒 并伴随有 nullnullnullnull 卫 星 nullnull nullnullnullnull 年 nullnullnullnull 等在台湾从表现为卷叶 小泡 畸 形 叶脉黄化和萎缩的辣椒上首次发现的 nullnullnullnullnullnullnull 是双组分病毒 但并未检测到 nullnullnullnullnullnullnull nullnull 假酸 浆 nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnull nullnullnullnullnullnullnullnull 又名大千生 田珠 冰粉 水晶凉粉 蓝花天仙子 鞭 打绣球等 属茄科 nullnullnullnullnullnullnullnullnullnull 假酸浆属 nullnullnullnullnullnullnullnull 假酸浆原产于南美洲 在我国作为药用或观赏植物 栽培 四川 云南 广西等地均有分布 生于田边 荒 地 篱笆边 屋院周围 其全草可药用 有镇静 祛痰 清热解毒之效 nullnull 目前假酸浆上报道的病毒有番 茄 严 重 皱 纹 病 毒 nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnull nullnull 马 铃 薯 null 病 毒 nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnull nullnull 和 苜 蓿 花 叶 病 毒 nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnull nullnull 还未见其他病毒的报道 本研究采集了 表现叶片黄化和皱缩的假酸浆病株 从中分离 鉴定 出了菜豆金色花叶病毒属病毒 并对分离到的病毒 核苷酸序列进行了比对和进化重组分析 nullnull 材料与方法 nullnullnullnull 样品采集和 nullnullnull 提取 nullnullnullnull 年 null 月 在保山陇川县户撒阿昌族乡对田 间双生病毒病害进行调查时发现 田间部分假酸浆 植株表现出叶片黄化 皱缩等疑似双生病毒侵染引 起的典型症状 图 null 随机采集病株的叶片编号为 nullnullnullnullnullnull 采 用 nullnullnullnull 法 nullnull 提 取 病 株 叶 片 的 总 nullnullnull 图 null null 田间表现为黄化 皱缩症状的假酸浆植株 nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnull nullnullnullnullnullnullnullnull null nullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnull null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull null nullnullnullnull 假酸浆病样的 nullnullnull 检测 为了检测病叶中是否含有菜豆金色花叶病毒属 病毒 分别利用该属病毒 nullnullnullnullnull 基因组部分序列 的通 用 简 并 引 物 nullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnull 以 及 nullnullnullnullnull 通用简并引物 nullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnull nullnull 对假酸 浆总 nullnullnull 进行 nullnullnull 检测 同时利用 nullnullnullnull 和 nullnullnullnullnull 卫 星 nullnullnull 通 用 引 物 null nullnull null nullnull nullnull 和 nullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnull nullnull 表 null 分别检测是否含有病毒伴随的卫 星 nullnullnull nullnullnull nullnull卷第 null期 张水英等 侵染假酸浆的泰国番茄黄化曲叶病毒全基因组结构特征 表 null null 本研究所用到的引物及其序列 nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull 引物 nullnullnullnullnullnull 引物序列 nullnull nullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull 目的片段长度 null null nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull 目的 nullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnull nullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnullnullnullnull nullnullnullnullnull扩增 nullnullnullnullnullnullnullnullnull nullnul