非洲菊SPFH基因家族的鉴定及表达.pdf

DOI 10 19675 ki 1006 687x 2020 09003 收稿日期 Received 2020 09 03 接受日期 Accepted 2021 01 14 福 建 省 重 大 农 业 科 技 专 项 2015NZ0002 1 福 建 省 高 原 学 科 建 设 经 费 102 71201801101 和福建农林大学科技创新专项基金 KFA19037A CXZX2018076 KF2015108 资 助 Supported by the Major Agricultural Science and Technology Project of Fujian Province 2015NZ0002 1 the Plateau Discipline Construction Fund of Fujian Province 102 71201801101 and the Science and Technology Innovation Special Fund Project of Fujian Agricultural and Forestry University KFA19037A CXZX2018076 KF2015108 通信作者 Corresponding author E mail Laizx01 非洲菊SPFH基因家族的鉴定及表达 李乾玉 1 王秀美 1 陈裕坤 1 夏朝水 2 叶 炜 2 林玉玲 1 赖钟雄 1 1 福建农林大学园艺植物生物工程研究所 福州 350002 2 三明市农业科学研究院 三明 365000 摘 要 SPFH Stomain Prohibitin Flotillin and Hflk C 超家族蛋白是锚定在膜微区的多样化膜蛋白家族 参与调控植 物的生长发育 响应生物或非生物胁迫 基于非洲菊转录组数据 利用生物信息学对 SPFH GjSPFH 家 族 成 员 进 行 鉴 定 分析其基本理化性质 亚细胞定位和保守氨基酸序列 构建系统进化树 并进行蛋白互作预测 利用转录组 FPKM值 分析 GjSPFHs在非洲菊健康及感病时期的表达水平 利用荧光实时定量技术检测 GjSPFH家 族 成 员 在 不 同 组 织 根 茎 和 叶片 和 不 同 激 素 水 杨 酸 SA和茉莉酸甲酯 MeJA 处 理 下 的 表 达 模 式 结 果 表 明 非 洲 菊 包 含 8个 GjSPFH成 员 其 蛋 白长度在 285 393 aa之间 蛋白理论分子量在 31 22 10 3 43 14 10 3 之间 等电点为 5 53 9 80 其 中 有 4个蛋白为稳定 蛋白 4个 为 不 稳 定 蛋 白 均 定 位 于 线 粒 体 含 有 15个保守氨基酸序列 GjSPFH可分为 3个亚组 该蛋白家族不仅成员之 间可以发生互作 还与其他蛋白互作 非洲菊 GjSPFH基因家族能够响应根腐病胁迫 GjPHB6在感病时期表达量显著 高于健康时期 可能参与了非洲菊抵御真菌侵染的过程 非洲菊 GjSPFH基因的表达具有组织特异性 大部分 GjSPFHs 基因在叶片中表达量相对较高 本研究表明 GjSPFHs能够响应 SA和 MeJA的 胁 迫 并 呈 现 多 种 表 达 调 控 模 式 可 能 与 非 洲 菊抗病性有关 但不同成员的功能有所差异 图 6 表 3 参 42 关键词 非洲菊 SPFH基因家族 组织特异性 激素 实时荧光定量 PCR Identification and expression analysis of SPFH gene family in Gerbera jamesonii LI Qianyu 1 WANG Xiumei 1 CHEN Yukun 1 XIA Chaoshui 2 YE Wei 2 LIN Yuling 1 SPFH gene family tissue specific hormone qRT PCR 李乾玉 等 28卷 第1期 2022年2月84 1 2 5 GjSPFH家族在不同组织 不同激素处理下表达量的 qRT PCR分析 利用 TransZol Up试 剂 盒 http www 取 上 述 非 洲 菊处 理 材 料 的总 RNA 参 照 PrimeScriptTM 1st Strand cDNA Synthesis Mix试剂 盒 转 录 说明 书 进 行 cDNA合成 使用 DNAMAN6软件对 GjSPFH家族成员序 列 进 行 特 异 性引物 设 计 表 1 以 非 洲 菊 18sRNA为内参基 因进行 qRT PCR试验 以稀释 10倍的 cDNA为 模 板 采 用 罗 氏 LightCycler仪器进行相对表达分析 qRT PCR反应体系为 20 L 参 照 Hieff qPCR SYBR Green Master Mix试剂盒 95 预变 性 30 s 95 变性 10 s 60 退火 30 s 72 延伸 30 s 共 45个循环 每个样品进行 3次 重 复 检 测 非 洲 菊 不 同 组 织 部 位及不同激素处理下的 GjSPFHs表 达 水 平 各 基 因 成 员 相 对 表达量用 2 Ct 法 计 算 得 出 并 使 用 Excel软件进行数据统计 SPSS24 0软件的 Duncan法 进 行 差 异显 著 性 分析 P 0 05 及 Graphpad软件进行绘图 2 结果与分析 2 1 GjSPFH家族成员的鉴定及生物信息学 基 于 非 洲 菊 转 录 组 数 据 初 步 筛 选 出 17个 GjSPFH家族 相 关 基 因 通 过 HMMER与 CDD分 析 去 掉 不 具 备 完 整 SPFH 保守结构域的基因 最终获得 8个 SPFH家 族 基 因 表 2 结 果显示 在非洲菊转录组数据中 并未搜索到 Erlin蛋 白 参 照 拟南芥的注释信息 GjSPFH家族在 AtSPFH中共注释到 7个成 员 上 其 中 除了 AtHIR1注释到 2个成员外 AtSlp1 AtPHB2 AtPHB3 AtPHB6 AtHIR2和 AtHIR4均注释到一个成员 分析 GjSPFH家族蛋白成员的理化性质 表 2 发现 非洲 菊 SPFH蛋白长度主要在 285 393 aa之间 预测的蛋白分子 量在 31 22 10 3 43 14 10 3 之 间 理 论 等 电 点 在 5 53 9 80之 间 其 中 4个 成 员 GjHIR1 1 GjHIR1 2 GjHIR3 GjHIR4 等 电点小于 7显 酸 性 另 外 4个 成 员 GjSlp GjPHB2 GjPHB3 GjPHB6 等电 点 大 于 7显碱性 分析 GjSPFH家族成员蛋白 的 不 稳 定 系 数 表 明 有 4个 蛋 白 GjSlp GjPHB2 GjPHB3 GjPHB6 的 不 稳 定 系 数 小 于 40为稳定蛋白 其余为不稳定蛋 白 预 测 发 现 GjSPFH家族蛋白成员的平均亲水系数呈负值 表明它们均为亲水蛋白 分析蛋白质二级结构 表 3 发现 GjSPFH家族蛋白中 螺旋所占比例最大且均超过 45 亚细胞定位发现 8个非洲菊 SPFH蛋白均定位在线粒体 此外 GjHIR1 1还可能定位在细 胞质 2 2 GjSPFH家族成员保守结构域和保守基序 保守结构域 图 1 分析发现 8个 GjSPFH家族成员蛋白 表1 GjSPFHs定量引物 Table 1 Quantitative primers of GjSPFHs 基因 Gene 正 向 引 物 序 列 5 3 Forward primer sequence 5 3 反向引物序列 5 3 Reverse primer sequence 5 3 18sRNA TCAAAGCAAGCCTACGCTCT GCTTTCGCAGTTGTTCGTCT GjPHB2 GAGAGGGCTTCACACTTCAACATAG TGAGCTCTGATGATGGCACTACG GjPHB3 TTCGGCGTTGGTTCGTGATAG ACGGCCTTCGAGAACTCAGC GjPHB6 GCTCTAACGTTTGGGAAAGAGTTCAC TCGCAATGGCCTCACCTATCAGT GjHIR1 1 CGAGGCCGAGTCCAAGTACC AGGCTGCACCAATCTCCTTCATG GjHIR1 2 TGAAGGCGAAGCCGAGTCC GAACCCAAGCACGCTGTCC GjHIR2 TGCCGAAGGTGAAGCAGAATC CTGTCCCTAAGACCGTCCACTATC GjHIR4 CATAGACCAAGCAAGCGTAGGAGT ATTTTGACGTCGAGTGAGTTGATCC 表2 GjSPFH家族蛋白理化性质 Table 2 Physicochemical properties of GjSPFH family proteins 转录组基因 ID Transcriptome ID 基因注释 Annotation 基因 Gene 蛋白长度 Protein length 分子式 Molecular formula 理化性质 Physicochemical properties 分子量 Molecular weight M r 10 3 等电点 pI 不稳定系数 Instabiliy index 脂肪系数 Aliphatic index 平均亲水系数 Grand average of hydropathicity c102676 g1 AtSlp1 GjSlp 393 C 1921 H 3100 N 532 O 577 S 8 43 14 8 73 45 36 96 11 0 251 c50079 g1 AtPHB2 GjPHB2 345 C 1687 H 2768 N 482 O 495 S 8 37 98 9 80 43 23 98 99 0 140 c24356 g1 AtPHB3 GjPHB3 285 C 1380 H 2247 N 395 O 418 S 5 31 22 8 87 44 23 99 61 0 059 c22398 g1 AtPHB6 GjPHB6 296 C 1454 H 2393 N 427 O 421 S 3 32 69 9 92 40 72 106 82 0 103 c22995 g1 AtHIR1 GjHIR1 1 308 C 1498 H 2409 N 413 O 460 S 12 33 95 5 95 34 10 91 85 0 148 c43247 g2 AtHIR1 GjHIR1 2 289 C 1400 H 2255 N 385 O 431 S 14 31 83 5 58 25 23 93 11 0 119 c45946 g1 AtHIR2 GjHIR2 287 C 1393 H 2252 N 382 O 429 S 12 31 60 5 91 32 41 94 46 0 158 c38754 g1 AtHIR4 GjHIR4 304 C 1496 H 2386 N 412 O 455 S 11 33 78 5 53 24 09 92 34 0 216 表3 GjSPFH家族蛋白二级结构和亚细胞定位分析 Table 3 Secondary structure and subcellular localization of GjSPFH family proteins 基因 Gene 二级结构 Secondary structure 亚细胞定位 Subcellular localization 螺旋 Alpha helix 转角 Beta turn 延伸链 Extended strand 无规卷曲 Random coil GjSlp 46 82 4 33 13 99 34 86 线粒体 Mitochondrion GjPHB2 53 62 3 77 14 78 27 83 线粒体 Mitochondrion GjPHB3 55 79 3 86 17 54 22 81 线粒体 Mitochondrion GjPHB6 52 70 6 42 13 18 27 70 线粒体 Mitochondrion GjHIR1 1 65 26 1 62 12 34 20 78 细 胞 质 线 粒 体 Cytoplasm Mitochondrion GjHIR1 2 62 98 3 11 14 88 19 03 线粒体 Mitochondrion GjHIR2 65 85 2 09 15 33 16 72 线粒体 Mitochondrion GjHIR4 63 16 2 63 14 80 19 41 线粒体 Mitochondrion 非洲菊 SPFH基因家族的鉴定及表达 85Vol 28 No 1 Feb 2022 都含有 SPFH like superfamily结构域 根据各成员所含其他 保 守 结 构 域 的 不 同 将 其 分 为 以 下 3类 A类是含有 SPFH like u4结构域的 GjHIR1 1 GjHIR1 2 GjHIR2和 GjHIR4这 4个成员 B类是含有 SPFH prohibitin结构域的 GjPHB2 GjPHB3和 GjPHB6 C是含有 SPFH paraslipin HflC和 HflC superfamily结构域的 GjSlp 通过在线网站 MEME分析 GjSPFH家族成员蛋白质的保守 基 序 motif 共 鉴 定 到 15个保守 motif 图 2 所有的 GjSPFH 家族成员蛋白序列中均含有 motif 3 说 明 出 现 频 率 较 高 的 motif 在 GjSPFH基因中具有重要作用 每个家族成员保守基序的数 目及种类存在一定差异 并且同一亚组的蛋白成员保守基序 位置及种类大致相同 这说明 GjSPFH家族成员具有功能特 异性 也具有功能冗余的现象 如在 HIR亚组中均含有 motif 1 2 4 6 8 11 14 在 PHB亚组中均含有 motif 5 7 9 10 12 15 结 合 MEME分 析 结 果 使 用 Pfam在线数据库对这 15个基序查询 注释发现 motif 2 3 4 5 7代表 SPFH结构域 2 3 GjSPFH家族成员序列比对及系统进化 利用 DNAMAN软件对 GjSPFH家族成员的 CDS进行序列 比 对 发 现 其 长 度 在 858 1 182 bp之间 序列较长的成员有 2 个 分 别 是 GjPHB2的 CDS 1 038 bp 和 GjSlp的 CDS 1 182 bp 经序列比对发现 GjSPFH家族成员的编码序列一致性 较低 这与邸超的研究结论 26 相一致 其中相似度最高的一 对为 GjHIR1 1和 GjHIR2 相 似 度 仅 为 53 利用 Phytozome数据库下载的拟南芥 水稻 SPFH超家族 蛋白 37条 氨 基 酸 序 列 与 非 洲 菊 转 录 组 鉴 定 出 的 8条 GjSPFH 成 员 氨 基 酸 序 列 进 行系 统 进 化 树 的 构 建 图 3 参考拟南芥 和水稻中 SPFH超 家 族 蛋 白 的 分 类 非 洲 菊 SPFH超蛋白家族 可分为 HIR Slp和 PHB这3类 其 中 HIR和 PHB亚组中成员较 多 分 别 包 含 4个 GjHIR1 1 GjHIR1 2 GjHIR2和 GjHIR4 和 3个 GjPHB2 GjPHB3和 GjPHB6 成 员 Slp亚组只包含一 个 GjSlp 2 4 GjSPFH家族成员蛋白互作预测 蛋白 互作 预 测 结 果 图 4 显 示 3个亚组的蛋白都与 PHB 蛋白发生强烈的互作 预示 GjSPFH蛋白家族自身成员之间发 生互作 除了 GjSlp以外 GjSPFH蛋白家族成员还会和其他蛋 白互作 例如 PHB和 HIR两个亚组的蛋白都与 CI51互 作 预 示着 GjPHBs和 GjHIRs的功能与 AtCI51有着一定的关联 2 5 GjSPFH家族在健康和感病时期的基因表达水平 依据非洲菊转录组数据中健康植株和感染根腐病病原菌 图2 GjSPFH家族蛋白的motif分布图 Fig 2 Protein motif distribution map of GjSPFH family proteins 图1 GjSPFH家族蛋白的保守结构域分类图 Fig 1 Conserved domain classification map of GjSPFH family proteins 李乾玉 等 28卷 第1期 2022年2月86 植株 SPFH基因的 FPKM值分析 GjSPFH的表达差异 分析 结 果 图 5 表明 在非洲菊健康和感病植株中 GjHIR1 1和 GjHIR4的表达量相对较高 GjPHB6和 GjSlp的表达量相对较 低 感 病 后 GjHIR1 1 GjHIR1 2 GjHIR2 GjHIR4和 GjPHB6 上调表达 GjSlp GjPHB2和 GjPHB3下 调 表 达 进 一 步 分 析 发现 仅 GjPHB6在感病时期表达量显著高于健康时期 以上 结果表明非洲菊 GjSPFH基 因 家 族 能 够 响 应 根 腐 病 胁 迫 其 中 GjPHB6可能与非洲菊防御真菌侵染过程有关 2 6 不同组织部位及不同激素处理下GjSPFH家族表 达量的qRT PCR 利用 qRT PCR检测 GjSPFHs在非洲菊不同组织部位的 表 达 情 况 结 果 图 6A 显 示 GjSPFHs基因家族 5个成员 GjHIR1 1 GjHIR1 2 GjHIR4 GjPHB3和 GjPHB6 在 叶 片中的表达量最高 GjSPFHs基因家族 2个 成 员 GjPHB2和 GjHIR2 在 茎 中 的 表 达 量 最 高 除 GjHIR1 2以外 GjSPFHs 基因家族成员在根的表达量均低于茎和叶片 进一步分析发 现 同一亚组的成员在不同组织部位的表达情况并不存在 相 似 的 趋 势 如 GjPHB3和 GjPHB6在 叶 片 中 表 达 量 较 高 而 GjPHB2在茎中表达量较高 利用 qRT PCR检测激素 SA和 MeJA处 理 后 非 洲 菊 叶 片 中不同 GjSPFHs的表达趋势 在 SA处 理 下 图 6B 与 对 照 组 0 h相比 GjPHB2 GjPHB3 GjHIR1 1 GjHIR2的表达趋 势为降 升 降 GjHIR1 2和 GjHIR4的表达趋势均为逐渐 下降 GjPHB6总体呈先上升后下降趋势 分析发现 SA处理 显著抑制了大部分 GjSPFHs基因家族成员的表达 在 MeJA 处 理 下 图 6C 与 对 照 组 0 h处理相比 GjPHB6呈 V 形表 达趋势 GjHIR1 2和 GjHIR4呈 N 形表 达 趋 势 GjPHB2 GjPHB3 GjHIR1 1和 GjHIR2呈 W 形表 达 趋 势 进一步分 析发现 MeJA处理 72 h后 7个 GjSPFH家族成员均上调表达 总之 GjSPFH基因家族能够响应 SA和 MeJA激素胁迫并呈现 多 种 表 达 调 控 模 式 表 明 GjSPFHs表达受到激素影响 SA和 MeJA是 与 植 物 抗 病 相 关 的 激 素 推 测 GjSPFHs表达与植物 的抗病性相关 3 讨论与结论 3 1 非洲菊SPFH家族特性分析 膜微区作为病原菌入侵宿主的平台 其动力学特性在植 物的先天免疫反应中具有十分重要的作用 参与病原菌的防 图4 非洲菊SPFH家族成员互作蛋白的预测 Fig 4 Predict and analysis of the interacting protein of SPFH family members in Gerbera jamesonii 图3 SPFH家族蛋白聚类分析 Fig 3 Phylogenetic tree of SPFH family proteins 图5 非洲菊SPFH基因家族在健康和感病时期的表达分析 CK为健康时 期 Dis为感染根腐病病原菌时期 Fig 5 Expression analysis of SPFH gene family in Gerbera jamesonii during health and pathogen infected periods CK Period of health Dis Period of pathogen infected 非洲菊 SPFH基因家族的鉴定及表达 87Vol 28 No 1 Feb 2022 御反应 27 近年来科学家们对位于膜微区的 SPFH超家族蛋白 进行了深入研究 为研究非洲菊 SPFH超家族蛋白提供了重要 理论基础 本 研 究 中 共 鉴 定 出 8个 SPFH超家族蛋白成员 其 中 HIR 4个 PHB 3个 Stomatin类 蛋 白 SLP 1个 分析发现 其家族蛋白成员的数量在不同物种间存在一定差异 如在拟 南芥中至少有 7个 AtPHB基因表达 28 已 证 明 拟 南 芥 中 存 在 4 个 HIR 29 玉 米 3个 HIR 30 大 麦 4个 HIR 31 对 8条 GjSPFH蛋 白序列的亚细胞定位分析发现 均定位于线粒体上 GjHIR1 1 还 可 能 定 位 于 细 胞 质 上 这 与 Browman等研究证明的含有 SPFH结构域的蛋白都定位于线粒体 细胞质膜等生物膜系 图6 GjSPFHs在不同组织部位的相对表达量 A 以及GjHIR1 1 GjHIR1 2 GjHIR2 GjHIR4 GjPHB2 GjPHB3和GjPHB6在不同激素处理下的 表达水平 B和C Root 根 Petiole 茎 Leaf 叶 SA 水 杨 酸 MeJA 茉莉酸甲酯 不同小写字母表示处理间差异显著 P 0 05 Fig 6 The relative expression levels of the GjSPFHs in different tissues A and the expression levels of GjHIR1 1 GjHIR1 2 GjHIR2 GjHIR4 GjPHB2 GjPHB3 and GjPHB6 under different hormone treatments B C SA Salicylic acid MeJA Methyl jasmonate Different lowercase letters indicate significant differences between the treatments P 0 05 李乾玉 等 28卷 第1期 2022年2月88 统上的结论 32 一致 通过 GjSPFH保守结构域分析发现 非洲 菊 SPFH家族蛋白成员的保守结构域均靠近蛋白的 N端 符 合 Hidesh等研究证明的 SPFH结构域特征 33 此外 SPFH结构 域 中 某 些 区域 片段 比 较 保 守 motif 2 3 4 5 7 同 时 不 同 亚 组具有的保守基序在种类上保持相对一致性 这种基因结构 的多样性预示着 SPFH蛋白家族生物学功能的多样性 在与拟 南芥和水稻构建的 SPFH家 族 蛋 白 聚 类 分 析 中 发 现 非 洲 菊 GjSPFH家族可分为 3个亚组 同一亚组成员能够与拟南芥和 水稻的亚组很好地聚类在一起 且具有相同结构域的成员也 能够聚类到同一亚组的分支上 这表明不同物种的 SPFH基因 具有相对的保守性 可能具有相对保守的分子功能 3 2 非洲菊SPFH可能参与植物生长发育与逆境胁迫 SPFH蛋白具有功能多样性 参与植物的生长发育与抗 逆 抗病等过程 在植物抵御病菌侵染过程中发挥着重要作 用 6 Zhou等研究发现在水稻中 OsHIR1与 OsLRR1蛋白互作 能够增强植物的抗病反应 34 李 赛 赛 等 研 究 证 明 转 OsHIR3 基因水稻能够显著降低水稻条纹病毒 rice stripe virus RSV 的积累量 增强水稻对水稻白叶枯病菌 Xanthomonas oryzae pv oryzae Xoo 的 抗 性 35 其他物种的 HIR基 因 包 括 ZmHIR3 30 TaHIR1 19 TaHIR3 20 GmHIR1 36 和大麦 HIR 31 均参与植物的抗病过程 本研究中分析非洲菊转录组 的 FPKM值发现 非洲菊 GjSPFH基因家族能够响应根腐病胁 迫 非 洲 菊 SPFH聚 类 分 析 结 果 表 明 除 GjPHB6以外同一亚 组的基因成员在感病时期的调控趋势基本一致 推测同一亚 组的 SPFH家族成员在非洲菊抗病过程中可能具有相对保守 的功能的 GjPHB6在感病时期表达量显著高于健康时期 表 明 GjPHB6可能与非洲菊抵御真菌侵染有关 基因在同一物种的不同组织表达情况存在差异 具有组 织特异性 例如 AtPHBs在 拟 南 芥 幼 苗 根 茎 茎 生 叶 莲 座 叶和花 5个组织中呈现出多样化的表达模式 26 AtHIR1在胚 轴和子叶中表达量较高 37 AtHIR3在根尖分生区表达量较 高 38 AtHIRs在花粉中均有表达 39 本研究中 8个 GjSPFH 在不同组织中具有显著的表达差异 大部分成员在叶片中表 达量较高 在根中表达量较低 同时 并未发现 GjSPFH基因 在不同组织中的表达模式和进化关系呈显著的相关性 例如 GjPHB2 GjPHB3和 GjPHB6在进化上属于同一亚组 但它们 在不同组织中具有不同的表达情况 GjSPFH的功能和具体调 控机制还需进一步研究 植物在外界的生物和非生物胁迫下会加速衰老 SA和 MeJA作为损伤刺激的内源信号分子 与植物的抗病反应存在 一定的联系 40 邱超等研究表明 AtPHBs基因在各种激素如 ABA SA MeJA等处理下低表达 且表达模式呈现多样性 26 Ahn等研究表明烟草中应用 VIGS沉默 NbPHB1和 NbPHB2基 因 导致线粒体完整性被破坏 早衰以及增强了对各种逆境 的敏感性 41 勒晶豪等研究表明辣椒 CaHIR4基因在外源激 素 SA和 MeJA处理下呈现出下调表达模式 且沉默 CaHIR4基 因减弱了辣椒植株对疫霉菌的抗性 42 本 研 究 中 对 GjSPFH 的部分家族成员在 SA和 MeJA处理下的表达情况分析发现 非洲菊 SPFH基因家族能够响应 SA和 MeJA胁迫并呈现出多 样化的表达模式 同一亚组的基因在响应激素表达情况上也 呈现出多样性 这表明在响应不同激素胁迫的过程中非洲菊 GjSPFH可能发挥不同的功能 本研究从非洲菊转录组中筛选到 8个非洲菊 SPFH基因 预测其蛋白长度在 285 393 aa之间 蛋白理论分子量在 31 22 10 3 43 14 10 3 之间 等电点为 5 53 9 80 含 有 15个保守氨 基 酸 基 序 均 定 位 于 线 粒 体 GjSPFH可分为 3个亚组 非洲菊 GjSPFH基因家族能够响应根腐病胁迫 GjPHB6在感病时期 表达量显著高于健康时期 可能参与了与非洲菊抵御真菌侵 染的过程 GjSPFH基因的表达具有组织特异性 还能够对抗 病 相 关 激 素 SA和 MeJA 的处理作出应答并呈现多种表达调 控模式 GjSPFH可 能 与 非 洲 菊 抗 病 性 有 关 但 GjSPFH成员 的具体功能还需进一步探索并验证 1 崔亚宁 李晓娟 林金星 李瑞丽 脂筏及其在植物细胞中的研究进 展 J 电子显微学报 2014 33 5 469 477 Cui YN Li XJ Lin JX Li RL Research progress on the lipid rafts in plant cells J J Chin Electr Microsc Soc 2014 33 5 469 477 2 Rivera Milla E Stuermer CA Malagatrillo E Ancient origin of reggie flotillin reggie like and other lipid raft proteins convergent evolution of the SPFH domain J Cell Mol Life Sci 2006 63 3 343 357 3 Choi HW Kim YJ Hwang BK The hypersensitive induced reaction and leucine rich repeat proteins regulate plant cell death associated with disease and plant immunity J Mol Plant Microbe Interact 2011 24 1 68 78 4 Hinderhofer M Walker CA Friemel A Stuermer CA M ller HM Reuter A Evolution of prokaryotic SPFH proteins J BMC Evol Biol 2009 9 1 10 5 Dempwolff F Wischhusen HM Specht M Graumann PL The deletion of bacteria dynamin and flotillin genes results in pleiotropic effects on cell division cell growth and in cell shape maintenance J BMC Microbiol 2012 12 1 298 6 曹阳阳 玉猛 鲁良 李晔 林金星 李瑞丽 植物 SPFH超家族蛋白 及其生物学功能研究进展 J 电子显微学报 2019 38 3 294 302 Cao YY Yu M Lu L Li B Lin JX Li RL Recent advances on SPFH superfamily proteins and their biological functions in plants J J Chin Electron Microsc Soc 2019 38 3 294 302 7 Bauer M Pelkmans L A new paradigm for membrane organizing and shaping scaffolds J FEBS Lett 2006 580 23 5559 5564 8 Borner GHH Sherrier DJ Weimar T Michaelson LV Hawkins ND MacAskill A Napier JA Beale MH Lilley KS Dupree P Analysis of detergent resistant membranes in Arabidopsis Evidence for plasma membrane lipid rafts J Plant Physiol 2005 137 1 104 116 9 Gehl B Lee CP Bota P Blatt MR Sweetlove LJ An Arabidopsis stomatin like protein affects mitochondrial respiratory supercomplex organization J Plant physiol 2014 164 3 1389 1400 10 Gehl B Functional and molecular characterisation of two stomatin like proteins from Arabidopsis thaliana D UK University of Glasgow 2009 11 Millar AH Sweetlove LJJ Gieg P Leaver CJ Analysis of the Arabidopsis mitochondrial proteome J Plant Physiol 2001 127 4 1711 1727 12 Zimmermann P Hirsch Hoffmann M Hennig L Gruissem W Genevestigator Arabidopsis microarray database and analysis toolbox J Plant Physiol 2004 136 1 2621 2632 13 Fujiwara M Umemura K Kawasaki T Proteomics of Rac GTPase signaling reveals its predominant role in elicitor induced defense response of cultured rice cells J Plant Physiol 2006 140 2 734 745 参考文献 References 非洲菊 SPFH基因家族的鉴定及表达 89Vol 28 No 1 Feb 2022 14 Vandenabeele S Van DKK Dat J Gadjev I Boonefaes T Morsa S Rottiers P Slooten L Van MM Zabeau M Inz D Van BF A comprehensive analysis of hydrogen peroxide induced gene expression in tobacco J PNAS 2003 100 26 16113 16118 15 Sieger SM Kristensen BK Robson CA Amirsadeghi S Eng EWY Abdel Mesih A M ller IM Vanlerberghe CC The role of alternative oxidase in modulating carbon use efficiency and growth during macronutrient stress in tobacco cells J J Exp Bot 2005 56 416 1499 1515 16 Christians MJ Larsen PB Mutational loss of the prohibitin AtPHB3 results in an extreme constitutive ethylene response phenotype coupled with partial loss of ethylene inducible gene expression in Arabidopsis seedlings J J Exp Bot 2007 58 8 2237 2248 17 Wang Y Ries A Wu K Yang A Crawford NM The Arabidopsis prohibitin gene PHB3 functions in nitric oxide mediated responses and in hydrogen peroxide induced nitric oxide accumulation J Plant Cell 2010 22 1 249 259 18 Chen F Yuan Y LI Q He ZH Proteomic analysis of rice plasma membrane reveals proteins involved in early defense response to bacterial blight J Proteomics 2007